Выплату стипендий БОУ «Югорский физико-математический лицей-интернат» не осуществляет.
Питание, проживание и обучение учащихся БОУ «Югорский физико-математический лицей-интернат» финансируется из средств окружного бюджета.
Для иногородних обучающихся предоставляется общежитие. Количество мест – 112. Плата за проживание не взимается.